Ondrej Prostredník je evanjelický teológ. Vo svojej akademickej práci sa venuje etike v textoch Novej zmluvy. Je editorom a autorom vedeckých publikácií venovaných extrémizmu, jeho dôvodom a predchádzaniu v náboženskom prostredí, ako aj otázkam vzťahu cirkvi a štátu. Vo svojej politickej práci sa venuje náboženskej neutralite štátu a ľudskoprávnej ochrane menšín.

V súčasnosti pracuje ako misijný pracovník v Evanjelickom cirkevnom zbore Bratislava Staré Mesto. Príležitostne ako tlmočník v inštitúciách EÚ. V minulosti pôsobil ako docent na Univerzite Komenského, generálny tajomník Ekumenickej rady cirkví na Slovensku a programový tajomník v oddelení pre misiu a rozvoj vo Svetovom luteránskom zväze v Ženeve. V roku 2018 získal ocenenie veľvyslanectva USA za obhajobu ľudských práv. V roku 2020 ho ocenila nadácia Herberta Haaga za zápas o slobodu v cirkvi.